Niezparzeczalne walory przyrodnicze gminy wiąża się z występowaniem dużych kompleksów leśnych stanowiących około połowę powierzchni ogółnej gminy. Walorem jest również położenie części gminy w kotlinie Wisły, w obszarze o wyjątkowych wartościach przyrodniczo- krajobrazowych, stanowiących z uwagi na swe bezpośrednie położenie, zaplecze ekologiczne zespołu uzdrowiskowo- rekreacyjnego miasta Ciechocinka.

Dominująca formą wypoczynku na terenie gminy Czernikowo jest wypoczynek świateczny. Wypoczynek ten koncentruje się głównie w rejonie jezior: Steklińskiego i Kijaszkowskiego, które zaliczane są do akwenów o wysokiej atrakcyjności turystycznej oraz w obrebie kompleksu leśnego w południowej części gminy.

Ważniejsze jeziora znajdujące się na obszarze gminy Czernikowo:

Jezioro Steklińskie

Położone jest na południowo- zachodnim krańcu Pojezierza Dobrzyńskiego.
Dno jeziora jest miechowate a najgłębsze miejsce znajduje się we wschodniej jego części i wynosi 18,5 m.
Brzegi misy jeziornej o wysokości 25 m posiadają dwa tarasy, niższy uniesiony 4 m nad zwierciadłem wody jeziora, wyższy- na wysokości 10 m.Linia brzegowa tego terenu jest słabo rozwinięta i mało urozmaicona.
Roślinność wynurzona porasta około 13 % długości linii brzegowej jeziora. Zlewnia jeziora leżąca w dorzeczu Lubianka- Drwęca- Wisła jest obszarem o niskim zalesieniu. Dominują tu użytki rolne intensywnie wykorzystywane.
Jedynym dopływem zasilającym jezioro jest rzeczka Lubianka I, która poniżej jeziora Steklińskiego łączy z rzeką Lubianką.

Jezioro Kijaszkowo

Położone jest na obszarze Pojezierza Dobrzyńskiego. Jest jeziorem rynnowym, przez które przepływa rzeka Lubianka. W bezpośrednim sąsiedztwie jeziora położona są stawy rybne o powierzchni 60 ha. Najbliższe otoczenie jeziora stanowią w około 80 % grunty orne i w 20 % łąki, pastwiska i nieużytki.
Jezioro to zaliczane jest do typu rybacko- sandaczowego.
Zachodni brzeg jeziora jest stromy i wysoki, wschodni natomiast jest niższy i o stokach łagodniejszych. Jezioro jest wypłycone materiałem nanoszonym przez rzeke Lubiankę. Występująca w jeziorze roślinność wynurzona zarasta prawie całą linię brzegową jeziora.